Fani Rosomaka, Burzy, Kolosa i innych bohaterów świata Marvel Comics bardzo ciepło przyjęli wcześniejszą grę osadzoną w ich ulubionym uniwersum – X-Men Origins: Wolverine. Koncern Activision zadecydował, że na kolejny tytuł z mutantami w rolach głównych nie trzeba będzie długo czekać. Przygotowanie X-Men: Destiny powierzono kanadyjskiemu studiu Silicon Knights, które w dorobku ma m.in. Blood Omen: Legacy of Kain oraz Too Human. Za warstwę fabularną odpowiada Mike Carey, autor scenariusza do komiksowej serii X-Men: Legacy. Akcja gry rozgrywa się po śmierci Profesora X. Miasto San Francisco podzielone zostaje na sektory, odrębne dla ludzi i mutantów. Konflikt przybiera otwartą formę. Główny bohater X-Men: Destiny jest dzieckiem zagorzałego antagonisty mutantów.