Przyszli na świat w świecie pełnym uprzedzeń i nienawiści. Na skutek mutacji genetycznej posiadają niezwykłe zdolności i potężną moc. Cyklop może emitować wiązki energii o ogromnej sile rażenia. Sztorm może kontrolować warunki pogodowe i zmieniać klimat. Ruda pochłania siły życiowe i wspomnienia każdego, kogo dotknie. W szkole profesora Xaviera (Patrick Stewart) - potężnego telepaty uczą się jak kontrolować i wykorzystywać swoje moce dla dobra całej ludzkości.
Teraz muszą stawić czoła największemu wrogowi - Magneto (Ian McKellen), który dysponując ogromną mocą odwrócił się od społeczeństwa, wierząc, że niemożliwe jest pokojowe współistnienie ludzi i mutantów. Magneto nie cofnie się przed niczym, by dowieść słuszności swoich przekonań, nawet, gdy zagrożona zostanie przyszłość całego rodzaju ludzkiego ... i nie tylko ludzkiego.