W Darkstar One: Broken Alliance wcielamy się w Kayrona Jarvisa, młodego pilota kosmicznego statku o nazwie Darkstar One i łowcę przygód w jednym. Wspólnie z nim przemierzamy kosmos (docierając do najdalszych jego zakątków), doświadczamy niezwykłych sytuacji, zawiązujemy liczne sojusze, bierzemy udział w kosmicznych starciach, a także handlujemy z przedstawicielami sześciu głównych ras zamieszkujących uniwersum gry, składające się z 330 układów słonecznych.

Wszystkie podejmowane działania i decyzje przybliżają nas do rozwikłania głównej tajemnicy – zagadkowej śmierci ojca głównego bohatera. Pomaga w tym naszpikowany technologiami statek Darkstar One oraz liczne kontakty Kayrona. W tle towarzyszą graczom makabryczne wydarzenia prowadzące do nowej, międzyrasowej wojny kosmicznej.

W Darkstar One: Broken Alliance dokonujemy samodzielnego wyboru najbardziej odpowiadającej ścieżki kariery. Możemy zostać podstępnym bandytą, interesownym najemnikiem, niebezpiecznym piratem, kupcem lub też wyjątkową kombinacją wszystkich dostępnych możliwości. W dużej mierze kierunek rozwoju zależy od tego, na jaki sposób rozbudowy Darkstar One zdecydujemy się w trakcie rozgrywki.

Jednym z najważniejszych elementów gry jest personalizacja kontrolowanego statku – do dyspozycji gracza oddane zostały setki rodzajów broni, tarcz, pancerza, a także innych, blisko dwustu komponentów, wpływających m.in. na prędkość, zwrotność itp. Dokonując konkretnych decyzji jesteśmy w stanie zmienić Darkstar One na przykład w ciężko uzbrojony frachtowiec, myśliwiec, bądź też krążownik.