Wyspa tajemnic to gra przygodowa, w wyraźny sposób nawiązująca do filmu Shutter Island w reżyserii Martina Scorsese i z Leonardem DiCaprio w roli głównej.

Fabuła gry w znacznym stopniu pokrywa się z wydarzeniami przedstawionymi w kinowej produkcji. Wcielamy się mianowicie w postać amerykańskiego agenta federalnego Teddy’ego Danielsa, który zostaje wysłany do szpitala dla obłąkanych o nazwie Ashecliffe, położonego na tytułowej wyspie Shutter. Zadanie głównego bohatera polega na zbadaniu tajemniczego zniknięcia jednej z pacjentek ośrodka – Rachel Solando. Śledztwo komplikuje się niedługo po dotarciu na miejsce, gdyż potężny huragan doprowadza do zerwania łączności między wyspą a resztą świata.

Właściwa rozgrywka jest typowa dla przygodówek typu hidden object. Oznacza to, że naszym głównym zadaniem jest staranna eksploracja kolejnych miejsc, połączona z odnajdywaniem interaktywnych przedmiotów. W trakcie zabawy do zbadania mamy kilkadziesiąt różnych lokacji położonych na terenie ośrodka, między innymi cele więźniów oraz biura zatrudnionych w szpitalu lekarzy.

Oprócz zbierania przedmiotów przewidziano także konieczność rozwiązywania prostych zagadek. Ważną informacją jest to, że zabawę możemy prowadzić na dwóch różnych poziomach trudności – łatwym i zaawansowanym, który przeznaczono dla bardziej doświadczonych miłośników gatunku.

Na oprawę graficzną Wyspy tajemnic składają się w głównej mierze statyczne dwuwymiarowe plansze. U dołu ekranu widoczna jest lista przedmiotów. Dodatkowo możemy skorzystać między innymi z dziennika głównego bohatera, pomocnego w doprowadzeniu śledztwa do pomyślnego finału.