Thomas Was Alone to niezależna gra platformowa oszczędnie dawkująca środki wyrazu. Obejmujemy w niej kontrolę nad kilkoma prostokątami i poruszamy się w prawą stronę po stu poziomach pełnych niebezpieczeństw. Naszym zadaniem jest wykorzystanie umiejętności poszczególnych postaci i dotarcie do portalu znajdującego się na końcu danego etapu.
Każdy z bohaterów posiada inne właściwości, które w połączeniu pozwalają na pokonanie nawet najtrudniejszych przeszkód. Przykładowo niebieski prostokąt potrafi bez problemu poruszać się po powierzchni wody, co jest niewykonalne dla pozostałych członków ekipy. Z kolei różowy, zawsze ustawiony w pozycji horyzontalnej, może podskoczyć w bardzo niewielkim stopniu, ale za to świetnie sprawdza się w roli trampoliny podbijającej wysoko towarzyszy.
Pomimo minimalistycznej otoczki gra Thomas Was Alone posiada rozbudowaną ścieżkę fabularną. W związku z tym, że prostokąty posiadają uczucia, poznajemy w trakcie zabawy ich słabości, radości, smutki i plany na przyszłość. Wszystkie sekrety głównych bohaterów opowiada podczas rozgrywki narrator.
Gra jest w formie giftlink i pochodzi z Humble Bundle - po zakupie wysyłam link, w którym należy się zalogować na konto Steam, po czym gra "dodaje się" do konta.