Beyond the Portals to oficjalna kontynuacja wydanej w 2007 roku gry Spectrobes, łączącej w sobie elementy klasycznego RPG-a oraz prostej zręcznościówki. Opisywany sequel nie wprowadza żadnych rewolucyjnych zmian do rozgrywki, oferując zbliżone rozwiązania do swojego poprzednika. Za przygotowanie gry ponownie odpowiedzialne jest studio developerskie Jupiter Corporation. Firma ta znana jest również za sprawą innej gry z gatunku RPG, a mianowicie The World Ends With You.
Miłośnicy pierwszej części serii mają okazję do tego żeby poznać dalsze losy dwójki intergalaktycznych oficerów. W przeciwieństwie do pierwszej części Spectrobes, w której grywalna była jedynie postać Rallena, tym razem przewidziano też możliwość przejęcia kontroli nad Jeeną. Fabuła drugiej odsłony cyklu w znacznym stopniu nawiązuje do zbadania okoliczności powstania portali prowadzących do odległych wymiarów galaktyki.
Właściwa rozgrywka ma bardzo zbliżony przebieg do pierwszej części. Kluczowy punkt zabawy stanowi odnajdywanie skamienielin tytułowych istot. Z usług tych stworów można bowiem następnie korzystać. Po odnalezieniu skamienieliny w pierwszej kolejności wykorzystuje się stylusa, symulując wykopywanie obiektu z ziemi. Następnie gracz musi dmuchnąć w mikrofon żeby ostatecznie odsłonić swoją zdobycz. Pozyskane Spectroby wykorzystuje się w trakcie staczanych walk, aktywując oferowane przez nie ataki oraz dodatkowe umiejętności. W danym momencie aktywne można mieć jedynie dwa stwory, co wymusza konieczność dopasowywania ich do aktualnie panujących warunków na polu bitwy.
Lista zawartych w sequelu nowości obejmuje przede wszystkim zmianę sposobu obserwacji otoczenia. Gra w większym stopniu stara się ukazywać trójwymiarowe plansze, których badanie wymagane jest do osiągnięcia ostatecznego sukcesu. Gracz w dowolnym momencie rozgrywki może teraz skorzystać z podręcznej mapy, na której zaznaczane są najważniejsze cele.
Tryb multiplayer oparty został o zupełnie nowy moduł o nazwie DGamer. System ten pozwala na wchodzenie w interakcje z graczami z całego świata. Uczestnicy zabawy mogą się ze sobą porozumiewać (także głosowo - obsługa mikrofonu), przystępować do pojedynczych potyczek czy brać udział w bardziej profesjonalnych turniejach. Na potrzeby zabawy można także wygenerować trójwymiarowy avatar, symbolizujący prowadzoną przez siebie postać.
Akcja w dalszym ciągu rozgrywana jest na dolnym ekranie konsoli. Górny ekranik może natomiast służyć wyświetlaniu okna inwentarza, statystyk postaci czy też mapy najbliższej okolicy. Grafika utrzymana jest w stylu dalekowschodniego anime.
