Azotany stanowią pożywkę dla glonów i z tego powodu ich stężenie powyżej 40 mg/l w akwariach i ozdobnych sadzawkach jest niepożądane. W stężeniu powyżej 80 mg/l stają się szkodliwe dla ryb, w wysokim stopniu szkodliwe w stężeniu powyżęj 120 mg/l. Przekroczenie dopuszczalnych zawartości azotanów świadczy o nadmiarze odpadowych substancji białkowych. Jakkolwiek obecność azotanów w wodzie akwarium jest znacznie mniej niebezpieczna niż amoniaku i azotynów, należy kontrolować i w porę ograniczać ich ilość.

Przy stężeniach przekraczających 40 mg/l należy dokonać częściowej lub prawie całkowitej wymiany wody w zależności od poziomu przekroczenia dopuszczalnego stężenia. Nadmiar azotanów świadczy o potrzebie oczyszczenia akwarium, podłoża i filtrów, niekiedy wskazuje również na konieczność ograniczenia ilości ryb.