Nie jesteś człowiekiem, jesteś PROTOTYPE. Kiedyś nazywałeś się Alex Mercer i byłeś mieszkańcem Nowego Yorku. Teraz posiadłeś tajemnicze moce, które pozwalają Ci dowolnie zmieniać kształ Twojego ciała. Wykształciłeś w sobie mordercze umiejętności walki, używasz podstępu, wtapiając się w swoich wrogów, przejmując ich wspomnienia i wygląd. Kamuflaż to Twoja nowa broń.

Twoim jedynym celem, jest odpowiedź na pytanie - Kto jest odpowiedzialny za to czym się stałeś? W poszukiwaniu swojej utraconej tożsamości użyjesz wszelkich możliwych sposobów i zlikwidujesz wszystko co stanie na Twojej drodze, aby się tego dowiedzieć. Dzięki swoim zdolnościom stałeś się praktycznie niezwyciężony. Możesz kreować biomasę w dowolny sposób, czyniąc z niej ostre jak brzytwa ostrze lub olbrzymi młot na swoich przeciwników. Możliwości ogranicza tylko Twoja wyobraźnia. Jesteś zmiennokształtnym, nic nie jest Ci obce.

• odkryj niespotykaną dotąd dowolność kształtowania swojego ciała. Używaj go jako najpotężniejszej z broni. Niszcz, siecz i rąb, atakuj wszystkimi możliwymi sposobami
• zmieniaj się w kogo tylko chcesz, bogatego biznesmena czy miejscowego włóczęgę. Wykorzystaj kamuflaż, aby ułatwić sobie zwycięstwo
• wykorzystaj pomoc innego gracza w trybie multiplayer, przetestuj unikatowy tryb współpracy
• dowiedz się, kto stoi za tajemnicą tego kim się stałeś. Rozwikłaj mroczną tajemnice rządu Stanów Zjednoczonych
• interaktywny, żywy świat, prawdziwej aglomeracji. Nowy Jork zaskoczy Cię swoimi możliwościami. Tłumy ludzi będą reagować na Twoje poczynania, nie zabraknie jednostek policyjnych i wojskowych, które będą chciały stanąć Ci na drodze.
• odkryj moce najniebezpieczniejszego bohatera gier wideo.