Pokemon Mystery Dungeon: Explorers of Time to tytuł, w którym pierwsze skrzypce grają Pokemony, natomiast rozgrywka nawiązuje do gier z serii Mystery Dungeon, którymi od lat para się studio Chunsoft.

W grze wcielamy się w człowieka tajemniczo przemienionego w Pokemona i obarczonego amnezją. Już na samym początku zaprzyjaźniamy się z innym Pokemonem, wstępujemy do gildii odkrywców i rozpoczynamy wędrówkę po lochach, która ma na celu poznanie przyczyn tajemniczej przemiany. Oczywiście na swojej drodze spotykamy masę bohaterów, zdobywamy liczne przedmioty, a także możemy natknąć się na ponad 490 różnych Pokemonów.

Nietypową cechą Pokemon Mystery Dungeon: Explorers of Time jest sposób w jaki przygotowujemy się do gry. Na samym początku przechodzimy bowiem test zawierający kilka pytań, które pomogą ustalić jakim Pokemonem spośród 16 dostępnych będziemy grać. Rozgrywka sprowadza się do znanego z innych gier z serii schematu polegającego na wykonywaniu licznych zadań oraz kolekcjonowaniu kolejnych Pokemonów. Do tego nadal mamy do czynienia z połączeniem elementów RPG, gry strategicznej oraz turowej. Nieco więcej oryginalności wnosi za to sposób zabawy zapożyczony z gier typu Mystery Dungeon, który sprawia, że lochy generowane są na bieżąco, w losowy sposób, co zapewnia nieograniczoną liczbę niepowtarzalnych lokacji.

W razie gdybyśmy utknęli w jednym z lochów, do pomocy możemy wezwać innego gracza. Pokemon Mystery Dungeon: Explorers of Time pozwala łączyć się bezpośrednio dwóm konsolom Nintendo DS. Ponadto w trakcie oczekiwania na pomocną dłoń można przejść do pobocznej przygody, w trakcie której zdobywamy pieniądze zwane Poke oraz dodatkowe przedmioty.