Pestki dyni są cennym źródłem nienasyconych kwasów tłuszczowych, które zapobiegają odkładaniu się cholesterolu w naczyniach krwionośnych. Spożywanie ich zapobiega również rozrostowi i zapaleniom gruczołu krokowego, wspomaga leczenie stanów zapalnych nerek i pęcherza moczowego. Pestki dyni zawierają łatwo strawne białka, witaminę E oraz mikroelementy tj. selen, magnez, cynk, miedź i mangan. Ze względu na dużą zawartość cynku nasiona dyni polecane są jako składnik diety w leczeniu trądziku, opryszczki, wrzodów żołądka oraz niegojących się ran.