Gra Oni w dużym stopniu nawiązuje do klasyki filmów Anime, a jej fabuła jest czymś w rodzaju hołdu wobec wszystkiego, co zabawne i śmieszne w tym gatunku. Jest rok 2032, a my wcielamy się w rolę kobiecego agenta specjalnego o imieniu Konoko, którego zadaniem jest przeniknąć do przestępczego syndykatu i zniszczyć go. Walczymy w sceneriach podziemnego centrum badawczego i piętnastokondygnacyjnej komendy policji. W miarę rozwoju akcji odkrywamy kolejne tajemnicze podziemia oraz niepewność swoich dalszych losów. Co ważniejsze przekonujemy się, że nie wszystkim można ufać, choć na szczęście, w niektórych misjach możemy liczyć na pomoc policji lub najlepszego przyjaciela, prototypowego robota - Shnatama.
Konoko nie jest zwyczajną bohaterką, charakteryzuje się wieloma cechami osobowości, które trudno dostrzec w innych grach. Cały czas będziemy wykorzystywać jej nieprzeciętne umiejętności walki. Konoko potrafi obezwładnić i rozbroić wroga zadając zarówno podstawowe, jak i dość „egzotyczne” uderzenia, kopnięcia i rzuty. Do wyboru mamy szeroki arsenał broni, począwszy od pistoletów, a na wyrzutni rakiet skończywszy. Należy pamiętać, że wrogowie inteligentnie współdziałają ze sobą podczas akcji. Zraniony nieprzyjaciel stara się szybko zniknąć z pola widzenia, a jeżeli mamy przewagę liczebną, wycofuje się.