Fabuła Naruto opowiada o 12-letnim chłopcu o imieniu Uzumaki Naruto. Jednak nasz bohater nie jest zwykłym chłopakiem. W jego ciele uwięziony jest lisi demon. Z tego powodu wszyscy w wiosce po prostu nie lubią Uzumakiego, gdyż wspomniany wyżej demon wyrządził wiele szkód i zabił wielu ludzi. Tylko jeden człowiek okazuje naszemu bohaterowi trochę dobra. Nazywa się Iruka i stara się być miły dla chłopca na tyle na ile może, ponieważ lisi demon zabił jego rodziców, więc więcej dobra już okazać dla Naruto po prostu nie potrafi. Jednak Uzumaki chce, aby wszyscy w wiosce traktowali go z szacunkiem. Dlatego wybrał sobie za cel zostać najpotężniejszym ninja w wiosce. Jednak, aby tego dokonać musi przejść wiele naprawdę cięzkich szkoleń i treningów. Dla ułatwienia tego zrobiono 3 osobowe grupy. Naruto znalazł się w grupie ze swoja nieodwzajemnioną miłością Sakurą i swoim największym rywalem Sasuke.