New Nintendo 3DS będzie dostępne w werji czarnej i białej. Inna wersja urządzenia - New Nintendo 3DS XL (w Japonii 3DS LL) - będzie dostępne w kolorach metaliczny niebieski i metaliczny czarny. Przyciski A, B, X i Y będą oznaczone dodatkowo kolorami, takimi samymi, jak w przypadku kontrolera Super Famicon. Analogowa gałka, C-stick, bardziej przypomina przycisk i została zaprojektowana na wzór C-stick z GameCube. Można ją wykorzystać do sterowania kamerą w
Dragon Quest X: Online, Final Fantasy Explorers oraz
Monster Hunter 4G, zaś w
Super Smash Bros. for Nintendo 3DS posłuży jako przycisk specjalnego ataku.
Slot na kartridże został w New Nintendo 3DS umieszczony na przodzie urządzenia po lewej stronie. Z kolei przycisk zasilania można znaleźć z tyłu urządzenia. Dzięki nowej funkcji - automatycznemu dostosowywaniu jasności ekranu w zależności od oświetlenia - bateria może działać dłużej. Osoby, które potrzebują sporo pamięci, mogą korzystać z kart Micro SD - odpowiedni slot znajduje się pod obudową. Urządzenie zostało wyposażone także w lepszy procesor, dzięki czemu na New 3DS będą mogły powstawać lepiej wyglądające gry, jak np. RPG Xenoblade Chronicles, w które mieli już okazję zagrać posiadacze Wii.
Poprawiono także wyświetlanie - uprzednio, patrząc od boku na ekran, widać było zamazany obraz. Teraz będzie można cieszyć się widokiem 3D patrząc także pod innymi kątami - urządzenie wykorzystuje kamerę i czujniki położenia, by określić, gdzie znajduje się twarz gracza. New Nintendo 3DS wyposażone jest także w czytnik NFC na dolnym ekranie, który pozwala na bezpośrednie umieszczanie na nim zabawek Amiibo.
