W MySims SkyHeroes przejmujemy kontrolę nad początkującym, nieznanym szerzej pilotem o wielkich ambicjach, który jako członek ruchu oporu staje do walki z Morcubusem, władcą przestępczego świata. Wspólnie z bohaterem SkyHeroes zasiadamy za sterami samolotu i bierzemy udział w dynamicznych walkach powietrznych, przeplatanych przerywnikami filmowymi rozwijającymi wątek fabularny serwowany przez twórców gry.

Rozgrywka polega przede wszystkim na uczestnictwie w standardowych, powietrznych starciach z żołnierzami armii Morcubusa, w tym z potężnymi bossami wymagającymi stosowania wyszukanej taktyki, a także na wykonywaniu zadań w ramach różnorodnych wyzwań. W miarę sukcesów oraz osiągania kolejnych poziomów doświadczenia, gracz uzyskuje dostęp do nowych części oraz elementów wyposażenia aeroplanu. Decydując się na wymianę lotek lub całego skrzydła zwiększa jego manewrowość, montując nowy silnik poprawia prędkość, z kolei decydując się na nałożenie barw maskujących utrudnia życie wirtualnym przeciwnikom.

W grze oprócz kampanii dla pojedynczego gracza, zawarty został tryb multiplayer (podzielony ekran), w ramach którego jednoczesnej zabawie może się oddać kilku fanów marki MySims.