Z nowości, które zostały ujęte w dziele NetherRealm Studios, warto wymienić dwa tryby rozgrywki: Story Mode (który nie jest jedynie miernym dodatkiem, a pełnowartościowym elementem), a także Tag Team. W przypadku tego ostatniego chodzi oczywiście o bitwy dwuosobowych zespołów – w rozgrywce sieciowej oznacza to możliwość uczestniczenia w walce nawet czterech graczy jednocześnie. W ramach trybu multiplayer nabywcy Mortal Kombat mogą również wziąć udział w klasycznych walkach 1-na-1 (także offline przy jednej konsoli) oraz w trybie Co-op Arcade Mode. Inną nowością jest tryb wyzwań, w którym bohaterowie gry muszą zmierzyć się z określonymi zadaniami, m.in.: pokonać nacierające na gracza hordy zombie, czy wygrać walkę wykonując tylko ciosy specjalne. Uzupełnieniem tego są różne mini-gierki dla wszystkich bohaterów gry.

Innowacją w serii jest również system X-Ray, służący do wyprowadzania specjalnych ataków. Opiera się on na podzielonym na trzy części pasku energii, ładowanym przez blokowanie ataków i zadawanie normalnych ciosów. Po naładowaniu paska możemy wykonać potężną sekwencję uderzeń. Każdy z zawodników dysponuje unikalną kombinacją X-Ray.

W grze znalazło się wielu znanych i lubianych bohaterów. Gracz może się wcielić m.in. w: Raidena, Shao Khana, Johnny’ego Cage’a, Reptile’a, Nightwolfa, Mileenę, Kung Lao, Sektora oraz Sub-Zero.