Dwóch przyjaciół staje do walki w bezlitosnej wojnie. Konflikt wciąż się zaognia.Koordynatorzy z ZAFT kontrolują już większość planety i szykują się do ostatecznego rozgromienia ziemskich sił zbrojnych. W centrum dowodzenia sił ziemskich.Przymierze jest gotowe i czeka na okazję do odparcia Koordynatorów i zepchnięcia ich aż na PLANTy. Czy ludzkość przekroczyła punkt,po którym nie ma już odwrotu?Marzenie o szybkim zapanowaniu pokoju wydaje się znikać,a wojna rozszerza swój zasięg równie szybko,jak wzrasta gniew ludzi. Odcinki 46 do 50: -Tam,gdzie odchodzą dusze, -Nowy koszmar, -Dzień gniewu, -Światło Apokalipsy, -W stronę nieskończonego jutra.