Cały sekret miodu manuka kryje się w kwiatach krzewu o takiej samej nazwie z których pszczoły zbierają nektar. Najważniejszym jego czynnikiem jest aktywny składnik antybakteryjny o nazwie methylglyoxal. Skuteczność działania miodu zależy od poziomu zawartości wspomnianego methylglyoxalu. Dla przykładu w zwykłych miodach jego zawartość kształtuje się w okolicy 3.1 mg/kg natomiast w miodach manuka dochodzi nawet do wartości 731 mg/kg