Men In Black: Alien Crisis to druga, kolejna po wydanym w 2002 roku Men in Black II: Alien Escape, adaptacja popularnej serii filmów science-fiction o tym samym tytule. Choć gra tworzona była równolegle z trzecią odsłoną kinowego cyklu, Men in Black III, to nie jest z nim bezpośrednio fabularnie związana.

Wcielamy się w agentów działającej w ukryciu organizacji MIB, zajmującej się wszelkimi przejawami życia pozaziemskiego, jakie mają miejsce na naszej planecie. Ubrani w stylowe czarne garnitury i noszący charakterystyczne okulary, podejmujemy się misji, od których powodzenia zależy nie tylko biurokratyczny porządek, ale nierzadko losy całego wszechświata. Pomimo elementów zręcznościowych jesteśmy również upoważnieni do używania brutalnej siły, jak na grę akcji przystało.

Choć tytuł nie jest bezpośrednią adaptacją trzeciej części filmowej sagi, jego akcja osadzona jest głęboko w doskonale znanym uniwersum, w którym nawet Elvis Presley i Sylvester Stallone byli tak naprawdę przybyszami z innej planety. Odwiedzimy nie tylko znane z kina lokacje, jak słynne centrum dowodzenia MIB, ale spotkamy również filmowych bohaterów. Wśród nich nie zabraknie oczywiście tych najbardziej znanych, Agenta J i Agenta K, granych przez Willa Smitha i Tommy’ego Lee Jonesa.