W Lego Island 2 gracz wciela się w postać Peppera, dostawcy pizzy, jednego z mieszkańców bajecznej wyspy Lego. Pada na nią wielkie nieszczęście, mianowicie Brickster ucieka z więzienia i wypuszcza armię botów, by rozbierały wszystkie konstrukcje zbudowane z klocków. Jakby tego było mało to Constructopedia, wielki zbiór planów budowlanych całej wyspy, zostaje skradziony.
Jako Pepper musimy zająć się poszukiwaniem zaginionych planów, dzięki którym będziemy mogli zrekonstruować zniszczone budynki i zabudowania, walką z wrogimi botami oraz masą innych wymagających wyzwań, m. in. jazdą na dinozaurze, lotem samolotem przez dżunglę i walką z Mrocznym Rycerzem. Wszystkie lokacje, w których toczy się gra, wykonane są przy użyciu trójwymiarowej grafiki. Spotkamy ponad 56 unikalnych postaci, z którymi możemy nawiązać rozmowę. Duża różnorodność czynności (możliwość budowy, ścigania się itp.) oraz unikalne otoczenie zrealizowane przy pomocy najsłynniejszych klocków Lego sprawiają, że gra jest niezwykle wciągająca.