Gra kontynuuje wątki filmowe, skupiając się na wielu pobocznych wątkach i elementach fabuły. Całość przybliża nam kulisy powstania przesiąkniętej złem organizacji Cobra, z którą dzielni amerykańscy wojownicy walczą od samego początku swojego istnienia. Tytuł oferuje wiele nowości względem filmowego pierwowzoru, stając się tym samym jego doskonałym uzupełnieniem, przybliżając odbiorcom wiele nieznanych wcześniej kwestii.

Autorzy przygotowali wiele wciągających poziomów, w których przede wszystkim walczymy z wrogimi oddziałami organizacji przestępczej Cobra. Gra została zrealizowana w konwencji strzelanki i w kwestii mechaniki zabawy nawiązuje do wielu klasycznych pozycji z tego gatunku. Przeciwników pokonujemy za pomocą prostego w obsłudze systemu walki wręcz oraz wykorzystując najrozmaitsze zaawansowane technologicznie bronie. Ponadto, wielokrotnie możemy zasiąść za sterami różnych pojazdów, które są przecież także cechą charakterystyczną marki G.I. Joe. Czasem musimy również sprawdzić się w pomniejszych, prostych mini-gierkach – np. w przypadku odpalania ataku z wojskowego satelity umieszczonego na orbicie planety.

Autorzy postanowili urozmaicić zabawę wprowadzając tryb kooperacji dla dwóch osób, w którym możemy zmierzyć się ze złowrogimi przedstawicieli Cobry ze znajomym, także na podzielonym ekranie. Do wyboru otrzymaliśmy dokładnie dwunastu bohaterów znanych z wcześniejszych przygód G.I. Joe, podzielonych na trzy klasy postaci: Commando (najskuteczniejszy w walce z bliska), Heavy Soldier (wykorzystującego najpotężniejsze bronie) i Combat Soldier (lubującego się w broni snajperskiej i eliminowaniu wrogów z dużych odległości).