Aparat Fujifilm X-A1 wyglądem przypomina model Fujifilm X-M1, z tą różnicą, że jest wyposażony w matrycę APS-C CMOS o rozdzielczości 16.3 megapikseli i procesor EXR II, dzięki czemu jego cena jest niższa.Matryca APS-C CMOS aparatu Fujifilm X-A1 daje możliwość wyboru czułości od standardowej ISO 200 do wysokiej ISO 6400 w krokach co 1/3 EV. Natomiast procesor EXR II gotowy do pracy w ciągu 0,5 s, w połączeniu z opóźnieniem migawki rzędu 0,05 s i możliwością wykonywania zdjęć seryjnych z maksymalną prędkością 5,6 kl./s (do 30 klatek). Fujifilm X-A1 posiada 3-calowy odchylany wyświetlacz LCD HD o rozdzielczości 920 000 punktów. Wszystkie przyciski i pokrętła są umieszczone z prawej strony tylnego panelu aparatu, aby zapewnić optymalną funkcjonalność i łatwość obsługi. Aparat jest wyposażony w dwa pokrętła sterujące, umożliwiające dostosowanie przysłony, czasu naświetlania i kompensacji ekspozycji przy użyciu kciuka. Poszczególne przyciski zapewniają dostęp do często używanych funkcji, takich jak balans bieli, tryb seryjny czy makro. Pokrętło wyboru trybu pozwala dobrać optymalną konfigurację sceny oraz daje dostęp do takich funkcji, jak zaawansowany tryb SR Auto, który automatycznie rozpoznaje rodzaj sceny i ułatwia uzyskanie najlepszych rezultatów, czy zaawansowany filtr wzbogacający zdjęcia o różne artystyczne efekty.