„Uzbrojony” w specjalny tatuaż i niezwykle misterny plan ucieczki, Michael, powoduje własne uwięzienie i rozpoczyna się wyścig z czasem. Teraz potrzebuje całej swojej przebiegłości, odwagi i szczęścia… a także pomocy jednego spośród najbardziej okrutnych i niebezpiecznych więźniów.

Większość ludzi zrobiłaby wszystko, żeby wydostać się z więzienia Fox River. Michael Scofield (Wentworth Miller) zrobi natomiast wszystko, by się do niego dostać. Jego brat, Lincoln (Dominic Purcell), został skazany na śmierć, za zbrodnię, której nie popełnił, a jedyna droga, by go uratować, wiedzie właśnie ze środka.

Odcinek 9 (TWEENER - 42:11)

Obawiając się o życie syna, Lincoln pragnie wydostać się z więzienia za wszelką cenę. Michael musi podjąć trudną decyzję, a zboczony T-Bag pastwi się nad młodym współwięźniem.

Odcinek 10 (SLEIGHT OF HAND - 42:11)

By móc kontynuować przygotowania do ucieczki, Michael jest zmuszony ujawnić miejsce ukrycia Fibonnaciego. - niewinnego człowieka, którego chce dopaść mafia. Tymczasem Kellerman i Hale otrzymują nieproszoną pomoc w swych poszukiwaniach L.J’a.

Odcinek 11 (AND THEN THERE WERE 7 - 41:57)

Wszyscy, a zwłaszcza Sara są zaszokowani, gdy do Michaela przybywa żona z małżeńską wizytą, przynosząc ze sobą istotny dla planów ucieczki szczegół.

Odcinek 12 (ODD MAN OUT - 41:26)

Moment ucieczki się zbliża i grupa musi zredukować o jednego swoją liczebność. Pada na T-Baga, ten jednak ma zupełnie inny pomysł. Tymczasem Veronica, Nick i L.J. ciągle uciekają walcząc o życie.