Na wykonanie czekają liczne misje, podczas których pilotować możemy siedem statków kosmicznych. Nie wybieramy ich jednak wedle własnego widzimisię, ale przydzielają je przełożeni w zależności od wyników. Każda maszyna posiada specyficzny dla siebie zestaw uzbrojenia, w którego skład wchodzą raczej typowe dla gier tego gatunku bronie. Użytek robimy też z impulsu elektromagnetycznego lub linki z hakiem służącej do przejmowania ważnych obiektów. Podczas potyczek akcję obserwujemy z wnętrza lub spoza statku. Podobnie jak w przypadku przeciwników, przed zniszczeniem chroni nas osłona, która słabnie po każdym celnym ataku.

Każdy “Akt” gry podzielony jest na trzy misje. Gra oferuje przy tym nieliniową narrację. W zależności od naszych poczynań -- tego czy zrealizujemy wytyczne, czy nie -- są nam przydzielane inne zadania, np. w innych systemach gwiezdnych.

W Colony Wars gracz ma do dyspozycji rejestr osiągnięć “Pilot Statistics”, w którym znajdują się opisujące jego zmagania liczby i ranga. Wiąże się to poniekąd ze wspomnianym wyżej nieliniowym scenariuszem. Oprócz tego gra oferuje bazę danych z informacjami na temat planet i statków kosmicznych.

Gra oferuje kapitalna oprawę graficzną : przepięknie odwzorowana przestrzeń kosmiczna, pełna gwiazd, wielkich planet, ruchu pojazdów kosmicznych, całych stad wrogich myśliwców, dużych statków transportowych oraz ogromnych statków baz. Modele pojazdów są szczegółowo wykonane: składają się ze sporej liczby polygonów, ładnie cieniowanych oraz bogato teksturowanych. Wisienką na torcie są kapitalne efekty broni : smugi laserów, błyski pocisków uderzających w tarcze magnetyczne statków kosmicznych oraz ich eksplozję przypominają niebo w dniu 4 lipca w USA ( multiple light sourcing w tej grze to czołówka osiągnięć graficznych w tamtych czasach ).