Tym razem Milo Tatch, Kida i ich niezawodna załoga wyruszają na powierzchnię by rozwiać jego tajemnice. Podczas tej niebezpiecznej wyprawy walczą z wielkim potworem morskiem zwanym "Krakenem". Stawiają czoła duchom pustynii. A także powstrzymują szaleńca podającego się za Odyna przed zagładą świata. Kida dowiaduje się wielu rzeczy na temat strażnika Atlantydy, oraz właściwości kryształu - którego potem używa aby podzielią się wiedzą zaginionego lądu z resztą świata.