Analiza DNA teoria i praktyka

Autor: Ryszard Słomski (red.)
Wydawca: Uniwersytet Przyrodniczy w Poznaniu
Rok wydania: 2011
Wydanie: I
Stron: 573
Format: 170 x 240 mm
Oprawa: miękka
ISBN: [zasłonięte]978-8360-607-6

Opis:

Zebrane w książce przykłady analiz DNA powstały na podstawie dwudziestoletniego doświadczenia wynikającego z przeprowadzenia szkół letnich POSTĘPY BIOLOGII MOLEKULARNYCH w latach 1[zasłonięte]989-20. W Szkołach uczestniczyło ponad 800 osób reprezentujących m.in. wyższe uczelnie, instytucje badawcze i służby państwowe. Doświadczenia przestawione w książce wykonane zostały przez młodych pracowników nauki i łatwo mogą być powtórzone. Unikatową wartość stanowią przykłady wyników uzyskanych z zastosowaniem opisanych metod. Całość opracował prof. dr hab. Ryszard Słomski, pod którego kierunkiem kształciło się wielu autorów tej książki.

Ryszard Słomski jest profesorem zwyczajnym, kierownikiem Katedry Biochemii i Biotechnologii Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu, zastępcą dyrektora ds. naukowych w Instytucie Genetyki Człowieka PAN w Poznaniu, biegłym sądowym za zakresu genetyki człowieka oraz specjalistą z zakresu genetyki laboratoryjnej. Profesor Słomski jest w kraju pionierem badań DNA dla potrzeb diagnostycznych oraz prekursorem upowszechnienia diagnostyki molekularnej. Jako pierwszy wykonał badania z zakresu odcisku genetycznego i amplifikacji DNA metodą PCR. Obecnie zajmuje się diagnostyką molekularną chorób genetycznych, charakterystyką nowych genów człowieka, biotechnologią, badaniami medyczno-sądowymi i badaniem DNA z wykopalisk.

Spis treści:

1. Diagnostyka molekularna

2. Poznanie genomu człowieka i perspektywy analiz DNA

3. Nazewnictwo wariantów sekwencji DNA, RNA i białek

4. Pobieranie materiału biologicznego. Przechowywanie i przewożenie próbek

5. Izolacja DNA

6. Izolacja RNA

7. Ilościowa i jakościowa ocena preparatów DNA i RNA

8. Elektroforeza kwasów nukleinowych

9. Barwienie DNA srebrem

10. Enzymy restrykcyjne, hydroliza genomowego DNA i przygotowywanie końców DNA do klonowania

11. Hybrydyzacja DNA z sondami molekularnymi. Metoda Southerna

12. Odcisk genetyczny

13. Hybrydyzacja typu northern

14. Reakcja łańcuchowa polimerazy (PCR)

15. Metoda odwrotnej reakcji PCR (IPCR). Oznaczanie sekwencji oskrzydlających gen

16. Amplifikacja całego genomu (WGA)

17. Charakterystyka regionów DNA o częściowo znanej strukturze

18. Klonowanie produktów PCR

19. Identyfikacja transformatorów bakteryjnych metodą kolonijnej reakcji PCR

20. PCR w czasie rzeczywistym

21. Synteza cDNA na matrycy całkowitego RNA

22. Przygotowywanie i przeszukiwanie bibliotek cDNA

23. Biblioteki DNA konstruowane z minimalnej ilości materiału

24. Wykrywanie mutacji punktowych i polimorfizmu DNA metodą SSCP

25. Wykrywanie mutacji metodą heterodupleksów

26. Wykrywanie mutacji metodą DHPLC

27. Dideoksy fingerprinting (DDF)

28. PCR multipleks

29. Wykrywanie delecji i duplikacji metodą MLPA

30. Diagnostyka molekularna chromosomu Y

31. Analiza powtórzeń ministelitarnych w DNA

32. Analiza powtórzeń dinukleotydów (CA)_n

33. Analiza powtórzeń trinukleotydów

34. Poszukiwanie powtórzeń trinukleotydów w genomie człowieka

35. Analiza powtórzeń tetranukletydów

36. Badanie DNA w medycynie sądowej

37. Polimorfizm inercyjno-delecyjny genu konwertazy angiotensynowej (ACE)

38. Polimorfizm genu reduktazy metylenotetrahydrofolianowej (MTHFR)

39. Polimorfizm genu dehydrogenazy alkoholowej (ADH3)

40. Wykrywanie mutacji i polimorfizmów genu DMD metodą PCR-RFLP

41. Przykłady genotypowań

42. Analiza występowania patogenów bakteryjnych w kieszonkach trzyzębnych

43. Wykrywanie Helicobacter pylori metodą PCR

44. Zastosowanie techniki RAPD-PCR do analizy porównawczej izolatów Fusarium avenaceum

45. Poszukiwanie markerów cech użytkowych metodą RAPD_PCR

46. Polimorfizm genu syntazy kwasu tetrahydrokannabinoilowego (THCA) konopi Cannabis sativa L.

47. Polimorfizm mitochondrailnego DNA człowieka

48. Test terminacji translacji (PTT)

49. Analiza międzygatunkowej homologii DNA i białka

50. Archeologia molekularna

51. Analiza sekwencji mitochondrialnego DNA z materiału wykopaliskowego

52. Przygotowanie produktów PCR do selekcjonowania

53. Selekcjonowanie DNA

54. Selekcjonowanie DNA - elektroforeza płytowa

55. Selekcjonowanie DNA - elektroforeza kapilarna

56. Piroselekcjonowanie - selekcjonowanie w czasie rzeczywistym

57. Analiza asocjacji w poszukiwaniu genów chorób uwarunkowanych wielogenowo

58. Analiza uwarunkowań genetycznych sportowców

59. Porównanie ekspresji genów na poziomie transkrypcji metodą różnicową

60. Ocena ekspresji genów z zastosowaniem mikro- i makromacierzy cDNA

61. Ekspresja eukariotycznych genów w bakteriach

62. Ukierunkowana mutageneza z zastosowaniem megastartera

63. Analiza modyfikowanych nukleozydów metodą chromatografii cienkowarstwowej

64. Analiza metyzacji DNA

65. Elektroforeza białek w żelu poliakryloamidowym

66. Oczyszczanie rekombinowanych białek

67. Dwukierunkowa elektroforeza białek

68. Wykrywanie małych ilości białek metodą hybrydyzacji western blot

69. Mapowania genów z zastosowaniem fluorescencyjnej hybrydyzacji in situ (FISH)

70. Przyżyciowe wykrywanie apoptozy w komórkach somatycznych

71. Analiza pęknięć nici DNA metodą elektroforezy pojedynczych komórek (comet assay)

72. Ocena fragmentacji DNA plemników SCSA

73. Wykrywanie fragmentacji DNA plemników metodą TUNEL

74. Analiza aberracji chromosomowych w chorobach nowotworowych metodą porównawczej hybrydyzacji genomów (CGH)

75. Metoda array-CGH