A.R.E.S. Extinction Agenda jest rozgrywaną w dwóch wymiarach (choć grafika jest trójwymiarowa) strzelanką w stylu Abuse. Wcielamy się w nowoczesnego robota bojowego nazwanego Ares. Jego misja zakłada rozprawienie się z agresywnymi maszynami starszej generacji, które przejęły kontrolę nad stacją kosmiczną. W realizacji tego zadania pomaga mu Vakyl - czyli mała sonda uzbrojona w potężne działo laserowe.

Pod koniec XXI wieku poziom zanieczyszczenia Ziemi przekroczył stan krytyczny. By uratować naszą planetę przed zagładą powołano United Earth - organizację złożoną z najtęższych umysłów na świecie. Po wielu zakończonych niepowodzeniem przedsięwzięciach zdecydowano się w końcu na zainwestowanie w nietypowy projekt autorstwa doktor Carson. Uważała ona, że najlepszym wyjściem będzie budowa olbrzymiej stacji kosmicznej, która służyłaby jako miejsce przetwarzania odpadów w masę organiczną zdolną naprawić zniszczony ekosystem Ziemi. Projekt okazał się sukcesem, a prędkość jego działania była tak wielka, że według prognoz za kilkadziesiąt lat stan zanieczyszczenia miał zostać zredukowany o 75%. Niestety, radość ludzi nie trwała zbyt długo, ponieważ wkrótce potem odkryto, że w stronę stacji zmierza sporych rozmiarów tajemniczy kryształ. Wbrew przewidywaniom kolizja nie zniszczyła jednak umieszczonej na orbicie struktury. Zamiast tego przy uderzeniu z kryształu wydobył się dziwny gaz, który wypełnił wszystkie korytarze i pomieszczenia. Systemy pokładowe szybko wznowiły działanie, choć jednocześnie przestały odpowiadać na komendy z Ziemi. Ostatecznie podjęto decyzję o wysłaniu misji załogowej pod dowództwem samej Carson w celu zbadania sytuacji i odzyskania kontroli nad stacją. Na miejscu okazało się, że gaz w jakiś sposób wpłynął na znajdujące się tam maszyny aktywując w nich agresywne zachowania. Jeden z członków zespołu został zabity, a reszta zabarykadowała się w jednej z sekcji i wysłała do bazy wiadomość zawierającą wołanie o pomoc oraz próbkę gazu. Naukowcy na Ziemi odkryli jakie metale są odporne na działanie tajemniczej substancji i z ich pomocą zbudowali robota bojowego (tytułowego Aresa, w którego wcielają się gracze), którego misją jest udanie się na stacje, zniszczenie agresywnych maszyn i uratowanie uwięzionych tam ludzi.

Rozgrywka w A.R.E.S. Extinction Agenda oparta jest na klasycznych mechanizmach platformowówkowych. Poruszamy się w dwóch wymiarach, a większość czasu spędzamy na pokonywaniu przeszkód oraz walce. Podczas przygody będziemy musieli pokonać setki wrogich robotów, a od czasu do czasu zmierzymy się również z gigantycznymi bossami. Twórcy przygotowali ciekawy system pozwalający wykorzystywać części pokonanych wrogów do tworzenia nowych przedmiotów takich jak amunicja, moduły naprawcze czy ulepszenia broni. Grę stworzono wyłącznie z myślą o pojedynczym graczu.