Jack Bauer (Kiefer Sutherland), który pełnił funkcję Dyrektora Operacyjnego CTU walczył z terrorystami grożącymi uwolnieniem śmiertelnego wirusa, który położyłby kres milionom istnień. Sezon 4 rozpoczyna się 18 miesięcy po tych dramatycznych wydarzeniach. Na czele CTU stoi teraz Erin Driscoll (Alberta Watson), twarda i nieustępliwa agentka rządowa, której jednym z pierwszych priorytetów było pozbycie się Jacka, zanim przejmie swoje nowe obowiązki. Tymczasem, po ataku bombowym na podmiejski pociąg, Jack, który obecnie pracuje dla Sekretarza Obrony Jamesa Hellera (William Devane) i związany jest uczuciowo z jego zamężną córką Audrey Raines (Kim Raver), zmuszony jest nagle wrócić do CTU na spotkanie z Driscoll...