Happy Feet Two to przede wszystkim gra familijna, która pozwala samodzielnie lub w trybie kooperacji zmierzyć się z szeregiem wyzwań, w kilku dostępnych w grze trybach rozgrywki. Wśród nich znalazł się charakterystyczny dla pingwinów cesarskich zjazd z góry na brzuchu, turniej taneczny oraz pływanie rytmiczne. W „dwójce” taniec i rytm odgrywają bardzo ważną rolę, bowiem to dzięki zaliczeniu sekwencji muzycznych gracz otrzymuje możliwość rekrutowania pingwinów wyposażonych w specjalne zdolności, pomocne przy ogłuszaniu przeciwników, manipulowaniu otoczeniem i rozwiązywaniu mini-zagadek.